Amputechture

O terceiro LP de originais foi lançado no dia 12 de Setembro de 2006. Gravado em Los Angeles, Califórnia, El Paso, Texas (ambos nos Estados Unidos) e em Melbourne, Austrália, foi mais uma vez produzido por Omar Rodriguez-Lopez. Ao contrário dos restantes álbuns, este não é um álbum conceptual, sendo antes uma série de histórias livremente contadas por Cedric, com a inclusão de memórias, histórias, pessoas, eventos, piadas. Embora sendo histórias sem ligação, são todas contadas na mesma pessoa. O álbum tem uma forte ligação com a religião, e a forma com que Cedric a encara. Um dos episódios relatados é o de uma freira romena que foi presa a uma cruz, amordaçada e colocada numa sala fria durante 3 dias. Morreu asfixiada. Para Cedric, a "religião é a razão porque existem tantos conflictos neste Mundo, e é simplesmente desnecessário acreditar num Deus de olhos azuis, cabelo branco e barba branca".

Músicos:

Omar Rodriguez-Lopez – Guitarra
Cedric Bixler-Zavala – Voz
Isaiah Ikey Owens – Teclas
Jon Theodore – Bateria
Juan Alderete – Baixo
Marcel Rodriguez-Lopez – Percussão

Paul Hinojos – Manipulação de Som

John Frusciante – Guitarra

Adrián Terrazas-González – Saxofone Tenor, Flauta e Clarinete Baixo

Sarah Gross – Saxofone em Meccamputechture

Lista de Músicas:
1. Vicarious Atonement – 7:19
2. Tetragrammaton – 16:41
3. Vermicide – 4:15
4. Meccamputechture – 11:02
5. Asilos Magdalena – 6:34
6. Viscera Eyes – 9:23
7. Day of the Baphomets – 11:56
8. El Ciervo Vulnerado – 8:50

Curiosidades:

O álbum esteve classificado no 9º lugar no The Billboard 200, no ano de 2006.

A música Viscera Eyes evoluiu de uma música composta por Omar desde os tempos dos At The Drive-In. A música Day of the Baphomets contém excertos da letra da música A Plague Upon Your Hissing, que remonta às gravações do álbum De-Loused In The Comatorium.

Este álbum foi o primeiro a contar com a presença de Paul Hinojos e o último com a participação de Jon Theodore.

O single extraído do álbum foi a música Viscera Eyes.

Todas as letras deste álbum foram escritas por Cedric Bixler-Zavala.
Toda a música deste álbum foi composta por Omar Rodriguez-Lopez.